【最新比較】勤怠管理システムおすすめ10選！選び方・料金・機能を徹底解説

ジョブカン勤怠管理は、出勤管理・シフト管理・休暇申請管理・工数管理の4機能を必要な分だけ組み合わせて使えるモジュール式の勤怠管理システムです。シリーズ累計導入社数は30万社以上（2025年時点）を誇り、中小から大企業まで幅広い規模で実績があります。

打刻方法はICカードやGPS、指静脈認証・顔認証のほか、LINE／Slack打刻などに対応しています。残業アラートや有休取得の催促通知も搭載しており、勤怠管理に必要な機能は軒並み揃えることが可能です

料金は有料プランが1機能・1名あたり月額200円（税抜）から。10名以下なら機能制限はあるものの無料プランも利用でき、30日間の無料トライアルで全機能を試すことも可能です。「ジョブカン給与計算」「ジョブカン労務HR」など同シリーズとのAPI連携で、勤怠から給与計算・労務管理まで一元化できるのも大きな強みです。

初めてクラウド勤怠を導入する企業や、コストを抑えながら必要な機能だけを揃えたい中小企業に向いています。

KING OF TIMEは、最大19種類の打刻方法を標準搭載する勤怠管理システムです。ICカードや生体認証（指紋・静脈）、PCログオン打刻、スマートフォンGPS打刻など、1つのシステムであらゆる現場の打刻ニーズに対応できます。通信障害時にはローカルで打刻データを一時保存して後からアップロードできるため、工場や地下設備など通信が不安定な環境でも安定した運用が可能です。

シフト管理・残業アラート・申請承認ワークフローといった基本機能を網羅しており、主要な給与計算ソフトとの連携も充実しています。多拠点を一元管理したい企業や、現場ごとに異なる打刻環境を統一したい企業から高く評価されています。

料金は1名あたり月額300円（税抜）の完全従量課金制で、使った人数分だけ払うシンプルな体系です。特殊な打刻環境を抱える製造業・医療・物流業や、複数拠点を持つ中堅〜大企業に特に適したサービスです。

freee勤怠管理Plusは、会計・給与・労務・人事など「freeeシリーズ」との完全連携を最大の特徴とするクラウド型勤怠管理システムです。勤怠データが自動的に給与計算や年末調整へ連動するため、手動での転記作業やデータ入力ミスを根本からなくせます。バックオフィス業務をfreeeシリーズで一本化したい企業にとって、最も導入コストが低い選択肢の一つです。

操作画面はシンプルに設計されており、ITに不慣れな担当者でも迷わず使える工夫がされています。打刻方法はICカード・スマートフォン・GPS・静脈認証に対応し、申請承認ワークフローや残業アラートも標準搭載しています。

料金は1名あたり月額300円（税抜）で、無料プランは設けていませんが、IT導入補助金の対象製品です。すでにfreee会計やfreee人事労務を利用している企業、あるいはこれからバックオフィスをfreeeで統一しようとしている中小企業に特におすすめです。

マネーフォワード クラウド勤怠Plusは、給与計算・会計・労務管理と密接に連携するバックオフィス統合型の勤怠管理システムです。従業員の出退勤データが自動的に給与計算と会計データに反映されるため、月次処理の転記作業や集計ミスを大幅に削減できます。フレックスタイム制・変形労働時間制など複雑な勤務形態にも柔軟に対応しており、就業ルールが多様な企業でも安心して運用できます。

打刻方法はICカード・スマートフォン・GPS・PC打刻に対応し、残業アラートや申請承認ワークフローも標準搭載です。料金は個別見積もりとなっており、企業規模や利用機能に応じて最適なプランを相談できます。

すでにマネーフォワード クラウド給与やマネーフォワード クラウド会計を導入している企業にとっては、データ連携の恩恵を最大限に受けられる選択肢です。バックオフィス業務のシームレスな統合を重視する中小〜中堅企業に向いています。

ハーモス勤怠は、30名以下なら無料で使えるクラウド型勤怠管理システムです。累計導入社数は12万社以上（2026年2月時点）を誇り、その低コストと機能の充実ぶりで中小企業を中心に高い支持を集めています。有料プランも1名あたり月額100円（税抜）〜と業界でも最安水準で、小規模から段階的に利用を広げやすい料金体系が特徴です。

打刻方法はスマートフォン・ICカード・Slack・LINEなど多彩に対応し、GPS打刻による位置情報記録や打刻漏れアラートも搭載しています。フレックスタイム制・変形労働時間制・裁量労働制など複数の勤務形態に対応可能で、シフト管理機能はオプションで追加できます。

「まずは低コストで試したい」「30名以下の小規模チームで導入コストを抑えたい」という企業に特に向いています。100名規模を超える運用は管理者の工数が増える場合があるため、事前に無料トライアル（30日）で確認することをおすすめします。

ジンジャー勤怠は、直感的な管理画面と多彩な打刻方法・外部ツール連携を特徴とする勤怠管理システムです。顔認証・ICカード・GPS・スマートフォンアプリに加え、Slackなどのビジネスチャットツールからもそのまま打刻できるため、現場の運用負担を最小限に抑えられます。人事担当者の管理画面もシンプルで、勤怠データの集計・アラート通知・承認状況の確認を一目で把握できます。

残業アラートや申請承認ワークフローはもちろん、給与計算ソフトとの自動連携にも対応しており、jinjerシリーズ（人事・給与・労務・経費）でバックオフィスを一本化することも可能です。上場企業の導入実績もあり、ある程度の規模に対応する信頼性を備えています。

料金は1名あたり月額400円（税抜）と、シリーズ連携型の製品の中では明確な価格設定がされています。パート・アルバイト比率が高い職場や、Slackなどの外部ツールと連携した現場運用を効率化したい企業に向いています。

タッチオンタイムは、打刻方法の豊富さと専用タイムレコーダーの充実を強みとする勤怠管理システムです。指紋・指静脈・ICカード・顔認証・GPS・Webブラウザ打刻など多様な手段に対応しており、独自開発の「タッチオンタイムレコーダー」1台で3種類の打刻方法を使い分けられるのが他にはない特徴です。

通信が届かない環境でもローカルにデータを保存してアップロードできるため、工場や地下フロアでも安定した打刻管理が可能です。シフト管理・残業アラート・申請承認ワークフロー・給与計算ソフト連携をすべて月額300円（税抜）/人の料金内で利用でき、追加オプション費用が発生しないシンプルな体系も評価されています。

導入企業数は60,000社以上（2025年1月時点）、サービス継続率は99.7%を誇ります。小売・飲食・医療・製造など業種を問わず幅広く導入されており、「打刻環境を徹底的に整えたい」「追加費用なしで全機能使いたい」という企業におすすめです。

CLOUZAは、勤怠管理に特化したシンプル設計のクラウド型システムです。タイムカードや勤怠管理機器メーカーとして長年の実績を持つアマノグループが開発しており、現場で使いやすいシステム設計と安定した運用品質が特徴です。初期費用ゼロ・月額200円（税抜）/人の従量課金制で、小規模チームから気軽に始められます。

スマートフォン・タブレットによる打刻に加え、GPSやジオフェンシング（指定エリア外での打刻をブロックする機能）を標準搭載しており、テレワークや直行直帰が多い職場での不正打刻リスクを抑制できます。残業アラートや申請承認ワークフロー、主要給与計算ソフトとの連携にも対応しています。

シフト管理機能は一部対応にとどまるため、シフト制勤務が複雑な職場では機能確認が必要です。一方で「とにかく操作をシンプルにしたい」「ITリテラシーに不安がある現場でも使えるものを探している」という企業には、扱いやすさの面で選択肢に入る製品です。

TimePro-eXは、大企業・多拠点・複雑な就業ルールを持つ企業向けに設計されたハイスペックな勤怠管理システムです。クラウド型とオンプレミス型の両方に対応しており、セキュリティポリシーが厳しい金融・医療・製造業などインターネット接続を制限する環境でも導入できます。工数管理・労務リスク管理・監査資料の自動生成など、大規模組織に必要な高度な機能を標準搭載しています。

打刻はICカード・PC・GPS・生体認証に対応し、細かなカスタマイズが可能な点も大きな特徴です。残業アラート・シフト管理・申請承認ワークフロー・給与連携を備えており、膨大な従業員データや複雑な集計ニーズにも対応できます。

料金は個別見積もりとなっており、導入・運用コストは他製品と比較して高めの設定です。一方で「複雑な就業規則をシステムに正確に反映させたい」「厳格な労務管理・内部統制対応が求められる」という企業にとっては、最も信頼性の高い選択肢の一つです。まずは問い合わせから要件を丁寧にすり合わせることをおすすめします。

スマレジ・タイムカードは、勤怠管理機能を30名まで無料で使えるクラウド型システムです。POSレジシステム「スマレジ」で知られる株式会社スマレジが提供しており、スマレジとの連携で人件費を含む売上分析まで一元管理できる点が他製品にはない独自の強みです。小売・飲食・サービス業の店舗経営者から特に支持されています。

打刻方法はスマートフォン・タブレット・GPS・顔写真撮影・ICカードに対応しています。有料プラン（プレミアム：月額2,420円〜）に移行すると、シフト管理・給与計算・年末調整・休暇管理・法定三帳簿の自動出力まで使えるようになります。残業アラート（労務アラート）や申請承認ワークフローも標準搭載です。

無料プランは30名まで勤怠管理機能が使え、60日間の無料トライアルで全機能を試せます。「まず無料で始めて、必要に応じて給与計算まで拡張したい」「すでにスマレジのレジシステムを使っている」という店舗経営者に特におすすめの製品です。